1000 Jahre nach den ‘Sieben Tagen des Feuers’, einem vernichtenden Krieg, ist die Erde von einem ‘Meer der Fäulnis’ überwuchert. Der riesenhafte Pilzdschungel dehnt sich durch Sporenabsonderung immer weiter aus und gefährdet die letzten Reservate der überlebenden Menschen. Das Tal der Winde ist einer der letzten friedlichen Plätze, an denen die Menschen in Ruhe und Frieden leben können. Regiert wird dieses kleine Königreich von einem weisen König, der eine junge Tochter hat: Prinzessin Nausicaä. Diese hat die unvergleichliche Gabe, mit Tieren und anderen Lebewesen zu kommunizieren. So gelingt es ihr als einzige, sogar die riesigen Ohmus zu besänftigen.
Als das Königreich Torumekia beginnt, sich alter Überreste von Waffen aus dem vergangenen Krieg zu bemächtigen, um das Meer der Fäulnis zurückzudrängen und andere Territorien zu erobern, droht ein neuer Krieg zwischen den Menschen. Doch Nausicaäs Vorsehung und ihr Mut vermögen dem hoffnungslos erscheinenden Krieg eine überraschende Wende zu geben.